Obstajata dve različni datotečni formati, imenovani Flash Video: FLV in F4V. Avdio in video podatki v FLV datotekah so kodirani na enak način kot v SWF datotekah. Oblika zapisa datoteke F4V temelji na osnovnem formatu ISO medijskih datotek in se začne s posodobitvijo programa Flash Player 9 3.